良太為了前往南海尋找自己失蹤的哥哥彌太，一直想要一艘船，某天良太參加一場比賽，比賽的第一名獎品正是一艘遊艇，但卻因為報名時間已過而徒勞無功，不過在因緣際會下結識了市野和仁田，三人一同到港邊去看遊艇，結果在其中一艘遊艇上遇到搶劫犯吉村，而急著尋找自己兄長的良太，趁著其他三人熟睡時將遊艇開出，結果在海上遇到暴風雨，四人漂流到一座島上，在那座島上四人發現海裡有龍蝦怪獸伊比拉，島上有神秘組織紅竹。紅竹似乎在島上進行一項不為人知的計畫，而四人正巧碰上了一位從紅竹手下逃脫的一位女原住民，在女原住民的幫助之下四人潛入紅竹的基地，沒想到卻誤觸警報，良太在驚慌中抓住了一個氣球往天空飄去，其他人為了逃避紅竹的追捕於是逃到山洞裡，沒想到他們發現了哥吉拉正在那山洞裡沉睡著...